El primer vagón del Tren Sanitario contiene un vacunatorio, cuatro puestos para hisopados y un laboratorio para analizar los testeos del programa "Buenos Aires Vacunate".
El segundo vagón posee dos consultorios médicos, un estar para los profesionales, una farmacia con heladeras y freezers donde serán almacenadas las vacunas.
Ambas unidades del cuentan con un grupo electrógeno ante posibles cortes de energía para preservar las vacunas.
Los médicos a bordo del Tren Sanitario realizarán vacunación COVID (a grupos de riesgo) y no COVID (gripe y neumonía), hisopados a casos sospechosos con test de antígenos, procesamiento y entrega de resultados.